Smyslem běhu je dát žákům možnost, jak si zvelebit školu. Žáci a zaměstnanci školy mají možnost navrhnout projekty týkající se vylepšení školy. Ze všech návrhů je vybráno žákovským parlamentem a vedením školy několik nejlepších a o těch poté žáci, jejich rodiče a zaměstnanci školy hlasují pomocí ankety. Na realizaci vítězného návrhu budou následně použity všechny peníze vybrané v rámci Běhu pro školu.
Každý běžec si sežene sponzory. Sponzor slíbí běžci určitou částku za každé uběhnuté kolo. Běžec poté v rámci sportovního dne zaběhne co nejvíce kol na jeden zátah. Stanovený rozhodčí mu do sponzorského listu potvrdí počet uběhnutých kol a běžec poté sponzorský list ukáže svým sponzorům. Ti pošlou slíbenou částku (počet kol x částka za kolo) na účet spolku. Spolek rodičů následně vybrané peníze použije na realizaci vítězného projektu.